尿路粘膜の炎症や損傷により知覚神経が過敏となり、尿の通過や膀胱収縮で疼痛が誘発される。結石では粘膜刺激や閉塞が加わり、血尿や疝痛を伴うことがある。

痛む時期が排尿開始時か終末時か、頻尿、尿意切迫、血尿、膿性分泌物、発熱、側腹部痛、性交歴を確認する。尿検査と尿培養を行い、男性では前立腺、女性では膣炎や外陰部病変も評価する。

膀胱炎では頻尿と終末時痛、尿道炎では排尿開始時痛や分泌物、前立腺炎では会陰部痛や発熱を伴う。膣炎や外陰炎では外陰部掻痒や帯下が目立つ。